В ЮГУ создан Учебно-научный аналитический центр природопользования, имеющий в своем составе лаборатории, оснащенные современным аналитическим оборудованием ведущих мировых производителей: PerkinElmer Mettler Toledo Vinci-Technologies FUNN и др.

• Лаборатория хроматографических методов исследований
• Лаборатория спектральных методов исследований
• Лаборатория радиационных методов исследований
• Лаборатория буровых промывочных жидкостей
• Лаборатория тампонажных смесей
• Лаборатория рентгеноструктурного анализа
• Лаборатория исследования свойств нефти и нефтепродуктов

В структуре университета имеются инженерные лаборатории:

• материаловедения;
• сопротивления материалов;
• механики грунтов;
• геодезии.

Инженерные лаборатории участвуют в работах по обследованию зданий и сооружений, которые проводит «Центр научных исследований и проектирования строительных конструкций» (ЦНИИПСК – ЮГУ).