Комплекс работ по выявлению, учёту и оценке распространения чужеродных биологических видов, представляющих угрозу для местных экосистем, с использованием современных молекулярно-генетических методов.
Основные преимущества:- Высокая точность видовой идентификации на генетическом уровне.
- Возможность обнаружения инвазивных видов на ранних стадиях распространения.
- Использование передового секвенационного оборудования.
- Отчёт о наличии/отсутствии целевых инвазивных видов в образцах
- Оценка степени распространения и потенциальной угрозы
- Рекомендации по мерам контроля и регулирования
- Полимеразная цепная реакция (ПЦР): избирательное умножение (амплификация) специфичных фрагментов ДНК целевых организмов
- Секвенирование ДНК: определение нуклеотидной последовательности амплифицированных фрагментов для точной видовой идентификации.
- Электрофорез в агарозном геле: визуализация результатов ПЦР и контроль качества ДНК на системе электрофореза и камерах для горизонтального электрофореза
- Флуориметрия: точное количественное определение концентрации нуклеиновых кислот
- Образцы биологического материала (фильтраты воды, пробы почвы, ткани организмов) в замороженном или консервированном виде
- Указание места, даты и метода отбора
- Список предполагаемых или целевых для поиска инвазивных видов
Этапы работ
- Полевой отбор биологического материала (вода, почва, биота)
- Выделение суммарной ДНК/РНК
- ПЦР-амплификация маркерных генов
- Секвенирование полученных фрагментов
- Биоинформатический анализ, сравнение с базами данных
- Подготовка заключения
Используемое оборудование
Области применения
- Экологический мониторинг водных и наземных экосистем
- Оценка биоразнообразия и выявление видов-вселенцев
- Контроль заноса инвазий с балластными водами, посадочным материалом и др
- Разработка и сопровождение природоохранных мероприятий
- Наличие ДНК/РНК целевых инвазивных видов
- Видовая идентификация на основе генетических маркеров
- Полуколичественная оценка обилия (при возможности)