Услуга включает профессиональную подготовку высококачественных библиотек нуклеиновых кислот для последующего секвенирования на платформах нового поколения (Illumina, Nanopore). Мы обеспечиваем все этапы: от контроля исходного материала до получения готовых библиотек, оптимизированных под конкретный тип анализа (геномный, транскриптомный, метагеномный и др.).
Основные преимущества:- Высокое качество и воспроизводимость результатов благодаря стандартизированным протоколам.
- Адаптация протоколов под конкретные цели исследования (цельногеномное секвенирование, ампликонное секвенирование, RNA-seq и др.).
- Контроль качества на каждом этапе с использованием флуориметрии и капиллярного электрофореза.
- Минимизация риска загрязнений и артефактов благодаря работе в чистых зонах.
Области применения
- Геномика: подготовка библиотек для цельногеномного (WGS) и целевого секвенирования
- Транскриптомика:подготовка библиотек для RNA-seq (тотальной РНК или обогащённой мРНК)
- Метагеномика и ампликонное секвенирование: подготовка библиотек для анализа генов 16S рРНК, ITS и других маркерных регионов
- Эпигенетика: подготовка библиотек для анализа метилирования ДНК (например, бисульфитное секвенирование)
- Поиск вариаций: подготовка библиотек для секвенирования экзома или панелей генов
Технические параметры услуги
- Срок выполнения: 5 - 10 рабочих дней (зависит от типа, количества образцов и сложности протокола)
- Стоимость: от 5 000 рублей за образец (стоимость зависит от типа библиотеки, необходимости обогащения и количества образцов в партии).
Используемое оборудование
Этапы работ
- Согласование программы исследований и типа подготавливаемой библиотеки
- Заключение договора
- Входной контроль качества исходной ДНК/РНК (оценка концентрации, чистоты и целостности)
- Подготовка геномной ДНК (фрагментация, репарация концов, аденозилирование) или РНК (обогащение мРНК, удаление рРНК, синтез кДНК)
- Лигирование адаптеров с уникальными индексами для мультиплексирования
- Очистка и амплификация библиотек (если требуется)
- Контроль качества готовой библиотеки (флуориметрия, капиллярный электрофорез)
- Квантификация, нормализация и подготовка к пулингу или передаче заказчику
Требования к исходным данным
- Высококачественная геномная ДНК или тотальная РНК, соответствующая требованиям по концентрации, чистоте (A260/280, A260/230) и целостности (для РНК - RIN > 7, для ДНК — отсутствие деградации).
- Чётко определённый тип требуемой библиотеки и платформа для последующего секвенирования.
- Информация о необходимости мультиплексирования (объединения) образцов и список требуемых уникальных индексов.
Результаты услуги
- Готовая библиотека ДНК/кДНК, прошедшая контроль качества
- Протокол подготовки с указанием всех использованных реагентов и параметров
- Отчёт о качестве библиотеки (размер фрагментов, концентрация, отсутствие загрязнений)
- Библиотека, готовая к отправке на секвенирование или передаче заказчику